Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms