Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms