Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms