Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms