Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam5Q3UKK2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam5Q3UKK2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms