Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf5Q3UK78 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms