Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms