Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dtx3lQ3UIR3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dtx3lQ3UIR3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms