Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitpnm3Q3UHE1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms