Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms