Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp36Q3UFY0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms