Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LbrQ3U9G9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms