Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U7U4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q3U7U4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms