Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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