Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gse1Q3U3C9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gse1Q3U3C9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms