Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms