Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms