Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
1700066B19RikQ3TS39 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms