Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms