Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp39Q3TIX9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms