Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afvQ3THW5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms