Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hp1bp3Q3TEA8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms