Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms