Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm1Q2TV84 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm1Q2TV84 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms