Protein–RNA interactions for Protein: Q208S0

Teddm2, Epididymal protein Me9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm2Q208S0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Teddm2Q208S0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Teddm2Q208S0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms