Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cers3Q1A3B0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms