Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpusd2Q149F1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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