Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtel1Q0VGM9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms