Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms