Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col19a1Q0VF58 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms