Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms