Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms