Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms