Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms