Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms