Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms