Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms