Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NrepQ07475 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms