Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms