Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms