Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms