Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mex3cQ05A36 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mex3cQ05A36 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms