Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vmn1r236Q05A06 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vmn1r236Q05A06 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vmn1r236Q05A06 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r236Q05A06 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r236Q05A06 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r236Q05A06 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r236Q05A06 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r236Q05A06 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Vmn1r236Q05A06 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r236Q05A06 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r236Q05A06 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r236Q05A06 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r236Q05A06 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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