Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms