Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms