Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms