Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms