Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcr5Q04683 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcr5Q04683 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms