Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CkbQ04447 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CkbQ04447 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms