Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms